Tietojenkäsittelytieteen koulutusohjelmassa suoritetaan perustutkintoina luonnontieteiden kandidaatin (LuK) ja filosofian maisterin tutkinto (FM). Molemmissa pääaine on tietojenkäsittelytiede. Kandidaatin tutkinto on sisällöltään yhtenäinen tietojenkäsittelytieteen koulutus, joka tarjoaa kattavan perustan rakentaa asiantuntijuutta maisterivaiheessa. Maisterivaiheessa laitoksen opetus jakaantuu kolmeen erikoistumislinjaan, jotka ovat Algoritmit ja koneoppiminen, Hajautetut järjestelmät ja tietoliikenne sekä Ohjelmistojärjestelmät. Laitoksella koordinoidaan myös englanninkielistä Bioinformatiikan maisteriohjelmaa.

Opetukseen ja sen kehittämiseen panostetaan pitkäjänteisesti. Laitos oli vuonna 2009 päättyneellä kolmivuotiskaudella yksi 20 yliopisto-opetuksen laatuyksiköstä Suomessa. Laitos sai myös tulevalle kolmivuotiskaudelle (2010-2012) saman laatuyksikköstatuksen; tälle kaudelle status myönnettiin vain kymmenelle yksikölle Suomessa monivaiheisen kansainvälisen arvioinnin perusteella.

Tietojenkäsittelytieteen laitoksella käytetään Legoja ohjelmoinnin oppimiseen ja opettamiseen.