Bioinformatiikan professori Sami Kaski on TKK:n kasvatteja Uusi bioinformatiikan professorimme, Samuel Kaski, sanoo olevansa täysiverinen tutkija. Teknillisestä korkeakoulusta laitoksellemme tullut tekniikan tohtori innostui ohjelmoinnista 10-vuotiaana ja alkoi haaveilla tieteenteosta vähän päälle parikymppisenä. Samuelin eli tuttavallisemmin Samin professuurin alana on data-analyysi ja sen sovellukset bioinformatiikassa. Tällä hetkellä hänen tutkimuksellisiin intresseihinsä kuuluu geeniekspressio, eli geenien toiminnan tutkiminen. ”Solun toimintaa mallinnetaan laskennallisilla keinoilla. Tähän sovelletaan data-analyysimenetelmiä kuten tiedonlouhintaa.” Samin muita projekteja ovat ihmisen endogeenisten retrovirusten etsiminen sekä proaktiivinen tiedonhaku.
Samin kiinnostus tietotekniikkaan lähti ohjelmoinnista. ”Monesti tietotekniikkainnostus syntyy juuri ohjelmoinnin kautta. Itselläni näin kävi 10-vuotiaana. Silloin se oli kivaa – nyt tietojenkäsittely on kiinnostavaa työtä!” Tutkijan ammatti alkoi kypsyä haaveena mielessä muutaman TKK-opiskeluvuoden jälkeen. ”Minulla oli haavekuvia siitä, mitä on hyvä tiede. Kiinnostavia asioita olivat algoritmit ja tekoälyn suuntaukset. Myöhemmin kuvaan tuli mallintaminen: joitakin tieteen ratkaisemattomia kysymyksiä voisi lähteä avaamaan laskennalla”, Sami muistelee. Entä bioinformatiikka? Systeemiajattelu biologiassa kiinnosti Samia jo varhain: miten luonto toimii? ”Tällä hetkellä tämä ala tarjoaa erittäin kiinnostavia haasteita ja näkymiä. Bioinformatiikka antaa tilaisuuden soveltaa ja kehittää tietojenkäsittelytiedettä itseäni kiinnostavalla tavalla.” Opiskeltuaan TKK:lla Sami jäi taloon ja väitteli tekniikan tohtoriksi tietotekniikan alalta vuonna 1997. Tämän jälkeen hän on toiminut post-doc-tutkijana, professorina ja Akatemiatutkijana. Helsingin yliopistolle Sami eksyi ensimmäisen kerran lukemaan psykologiaa, kandiksi asti. Professorina tietojenkäsittelytieteen laitoksella hän on juuri aloittanut, 1. maaliskuuta lähtien. ”Polin” kasvatti Sami toteaa TKK:n tietotekniikkaosastolla ja tietojenkäsittelytieteen laitoksella olevan enemmän yhteistä kuin eroavaisuuksia. ”Tutkimusaiheet erottavat enemmän kuin se, missä yksikössä tutkii. Yleinen assosiaatio saattaa olla, että TKK:lla tehdään enemmän soveltavaa ja tietojenkäsittelytieteen laitoksella perustutkimusta, mutta omasta mielestäni asia ei aina ole näin.” Samille työ on myös harrastus, mutta aikaa jää
myös perheelle, bassonsoitolle ja romaaneille. ”Basistina
tunnen tietysti kaikki basistivitsit!” |
