Tutkimus
Biomine-projektissa biologisten tietokantojen sisältö esitetään verkkona, jossa solmut vastaavat käsitteitä (esim. geeni, biologinen prosessi), ja kaaret niiden välisiä yhteyksiä. Projektin tavoitteena on kehittää menetelmiä ennestään tuntemattomien yhteyksien löytämiseen, toisin sanoen uusien biologisten hypoteesien tuottamiseen.
Yliopiston koko tutkimustoiminta arvioitiin vuonna 2005. Tietojenkäsittelytieteen laitoksen ja siihen saumattomasti liittyvän HIIT-tutkimuslaitoksen perustutkimusyksikön tutkimusta arvioi matematiikan ja tilastotieteen laitoksen kanssa yhteinen kansainvälinen paneeli. Arviointityö käynnistyi keväällä, jolloin paneelin käyttöön tuotettiin massiivinen tutkimuksen itsearviointiraportti tieteellisin julkaisuin höystettynä. Paneeli vieraili yliopistossa syyskuussa, jolloin se yhden viikon aikana haastatteli arvioitavien yksiköiden edustajia ja tuotti luonnokset arviointiraporteistaan.
Tutkimuksen arviointiraportit julkistettiin 1.3.2006. Helsingin yliopiston 75 arvioidusta yksiköstä korkeimman mahdollisen arvosanan (7) sai 20 yksikköä, niiden joukossa sekä tietojenkäsittelytieteen laitos että tietotekniikan tutkimuslaitos HIIT. Kun lisäksi matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta oli arvioinnissa ylivoimainen tiedekuntasarjan voittaja, voidaan laitoksen tutkimustoiminnan katsoa olevan kiistatta kansainvälistä huipputasoa.