Kehitämme algoritmeja ja tietorakenteita genomin laajuisten data-aineistojen analyysiin. Kyseessä olevia aineistoja on laajalti saatavilla modernien molekyylibiologian mittaustekniikoiden kuten uusien sekvensointiteknologioiden ansioista. Olemme erityisen kiinnostuneita soveltamaan tiiviitä tietorakenteita, jotka mahdollistavat erittäin toisteisten aineistojen analyysin tilassa, joka on verrannollinen aineiston informaatiosisältöön. Tutkimme myös muita skaalautuvuustekijöitä, kuten hajautettua laskentaa ja talletusta liittyen genomin laajuisiin data-aineistoihin.

Yhteyshenkilö: Professori Veli Mäkinen
Kotisivu: http://www.cs.helsinki.fi/gsa/